Konohagakure hatte bis jetzt fünf Hokage (火影, wörtlich "Schatten des Feuers"), seit der Erste Hokage das Dorf vor 60 Jahren gegründet hat. Die Fünfte Hokage ist die einzige Lebende und sie ist auch bisher als einzige Hokage weiblich. Die Hokage gehörten immer zu den stärksten Ninja in Konoha, es kann aber immer sein, dass es noch stärkere gibt. Den Titel Hokage behalten sie auch, wenn sie älter und schwächer werden. Der Hokage ist der Führer und Leiter von Konoha.
Der Erste Hokage
Siehe Hauptartikel: Hashirama Senju
Der Erste Hokage (初代火影, "Shodai Hokage") war der Bruder des Zweiten Hokage und der Großvater von Tsunade und Nawaki. Als Orochimaru Konohagakure zerstören wollte, wurde er von ihm mit einem Kin-Jutsu wiederbelebt und musste gegen den Sandaime Hokage kämpfen. Genaueres aus dem Kampf ist jedoch nicht bekannt. Er hieß Hashirama und erbaute damals Konohagakure mit Madara Uchiha. Es heißt, dass er die Kräfte der Bijū kontrollieren konnte. Ein paar seiner Zellen wurden von Orochimaru in Yamato gepflanzt, wodurch er auch sein spezielles Jutsu beherrscht. Im Tal des Schicksals hat er damals gegen Madara Uchiha gekämpft, da Madara und er verschiedene Meinungen zu den Auffassungen von Konoha hatten, diesen Kampf gewann jedoch der erste Hokage. Er gehörte dem Senju-Clan an und beherrschte als erster Ninja überhaupt das Element Mokuton.
Der Zweite Hokage
Siehe Hauptartikel: Tobirama Senju
Der Zweite Hokage (二代目火影, "Nidaime Hokage") war der jüngere Bruder des Ersten und Tsunades Großonkel. Er trug einen großen Teil dazu bei, dass Konoha eines der größten Mächte wurde. Er konnte sehr gut mit Wasserjutsus umgehen. Außerdem konnte er Wasser benutzen und beherrschen, ohne dass Wasser vorhanden war. Eine dieser Fähigkeiten war die "Wasser-Schockwelle" (水遁・水衝波, "Suiton: Suishōha"), welche ihm erlaubte, einen großen Wasserkörper zu formen und damit den Gegner anzugreifen. Er war der Lehrer des Dritten Hokage, Homura Mitokado und Koharu Utatane und derjenige, der den Dritten Hokage als seinen Nachfolger auswählte.
Der Dritte Hokage
Sarutobi im höheren Alter
Siehe Hauptartikel: Hiruzen Sarutobi.
Sarutobi (hinten), Sannin: Orochimaru, Jiraiya und Tsunade (v.l.n.r.)
Der Dritte Hokage (三代目火影, "Sandaime Hokage") und seine früheren Teamkamaraden, Homura Mitokado und Koharu Utatane, waren Schüler des Ersten und Zweiten Hokage. Wegen seines Nachnamens Sarutobi (猿飛, Sarutobi) nannten ihn der Erste und der Zweite "Affe" (猿 Saru bedeutet wörtlich "Affe"). Später war er der Meister von Jiraiya, Orochimaru und Tsunade, welche zu den Drei Legendären Ninja, den Sannin wurden (伝説の三忍, "Densetsu no Sannin"). Er ist der Vater von Asuma Sarutobi.
Der Dritte wurde wegen seines enormen Wissens über Jutsus "Professor" (プロフェッサー, "Purofessā") genannt. Während dem einzigen Kampf, bei dem er zu sehen ist, benutzt er eine Vielzahl von Attacken, die auf Feuer und Erde basieren. Zusätzlich zu diesen Jutsu kann er eine Neutralisierungstechnik (術消, "Jutsu Shō") anwenden, welche ihm erlaubt, den gegnerischen Angriff zu stoppen bzw. zu verhindern, indem er gleich viel Chakra benutzt. Nachdem er ein Shuriken auf seinen Gegner geworfen hat, kann er Shuriken Kage Bunshin no Jutsu (手裏剣影分身の術, wörtlich "Shuriken Schattenklon Technik") anwenden. Der Dritte kann zudem den Affenkönig Enma beschwören, der sich in einen Stab verwandeln kann, dessen Kontrolle von Sarutobi optimiert wurde. Trotz all dieser Fähigkeiten war der Dritte ein wenig lüstern, denn er verbrachte eine Menge Zeit mit jungen Frauen. Als Jiraiya noch sein Schüler war, bot dieser ihm an, ein Jutsu zu lernen, welches ihm ermöglichte, unbeobachtet zu spannen.
Als Orochimaru sein Schüler war, wollte der Dritte ihn zu seinem Nachfolger ernennen, doch mit der Zeit merkte er, dass Orochimaru nur Hokage werden wollte, um an Macht zu gelangen. So übergab der Dritte den Titel an den vierten Hokage. Nach dessen Tod übernahm wieder der Dritte die Leitung Konohas. Er fing an, die Quelle des Verschwindens einiger Ninja zu suchen und fand sie bei Orochimaru; er war aber nicht dazu fähig, Orochimaru aufzuhalten und so konnte dieser fliehen. Jahre später griff Orochimaru Konoha an, um seinen ehemaligen Meister zu töten. Im Kampf beschwor er den Ersten und Zweiten Hokage, die der Dritte mit dem Todesdämonensiegel, das die Seelen entzieht, besiegte. Er hatte das Gleiche mit Orochimaru vor, schaffte es aber wegen seiner Verletzungen nicht und konnte nur noch Orochimarus Arme untauglich machen. Nach dem Kampf starb er. Für ihn wurde eine große Gedenkfeier abgehalten, wobei sein Sohn Asuma zum ersten Mal gesehen wurde, ohne dass er rauchte.
Der Vierte Hokage
Siehe Hauptartikel: Minato Namikaze
Yondaime Hokage (四代目火影, "Der Hokage der vierten Generation") ist derjenige, der den neunschwänzigen Fuchsdämon in Naruto Uzumaki versiegelt hat. Durch das spezielle Jutsu, das er dabei anwendet, stirbt er. Doch vor seinem Tod bittet er die Dorfbewohner Konohas, Naruto nicht als Monster, sondern als Helden zu sehen, was aber von vielen nicht beachtet wird. Sein Sensei ist damals Jiraiya, der zu den legendären Sannin gehört. Der Vierte Hokage entwickelt auch das Rasengan.
Er zeigt laut verschiedenen Aussagen eine Reihe von Gemeinsamkeiten mit Naruto und dieser versucht ihm nachzueifern. In seiner Jugend ist der Vierte mit zwei anderen Ninja, über die bis jetzt weiter nichts bekannt ist, Schüler von Jiraiya. Später wird er Lehrer von Kakashi Hatake, Obito Uchiha und Rin. Er gilt als einer der größten Ninja, die jemals aus der Geschichte von Konoha hervorgegangen sind. Er entwickelt einige Techniken, wie die Technik des Fliegenden Donnergottes, die es ihm erlaubt, sich mithilfe eines Siegels blitzschnell an jede beliebige Stelle zu bewegen. Diese Fähigkeit hat ihm den Spitznamen "Konoha no Kīroi Senkō" (木ノ葉の黄色い閃光, "Konohas Gelber Blitz") eingebracht. Er ist mit Kushina Uzumaki verheiratet und der Vater von Naruto.
Der Fünfte Hokage
Siehe Hauptartikel: Tsunade
Tsunade ist der Fünfte Hokage (五代目火影, "Godaime Hokage"). Sie ist die Enkelin des Ersten und gehört zusammen mit Orochimaru und Jiraiya zu den Drei Legendären Sannin. Tsunade war zusammen mit Orochimaru und Jiraiya die Schülerin des Dritten Hokage. Sakura, Ino und Shizune sind Tsunades Schülerinnen. Tsunade sieht jung aus, ist aber in Wahrheit um die 50 Jahre alt.